Princip rada keramičkih membranskih filtara uglavnom se temelji na mikroporoznoj strukturi keramičkih membrana. Kada tekući materijal koji treba filtrirati prođe kroz određeni tlak, različite komponente u tekućem materijalu bit će presretnute na jednoj strani površine keramičke membrane, dok će bistra tekućina prodrijeti na drugu stranu površine membrane, čime se postiže odvajanje tekućine. i filtracija. Keramički film sastoji se od bezbrojnih nepravilnih sitnih keramičkih čestica sličnih kamenčićima, koje između sebe stvaraju pore. Veličina pora je samo 20-100 nanometara, što mu omogućuje učinkovito odvajanje tvari različitih veličina molekula.

U sustavu filtracije s keramičkom membranom obično postoji rotor koji se sastoji od nekoliko setova keramičkih filtarskih ploča, kao i komponenti kao što su distribucijska glava, mješalica, strugač itd. Kad rotor radi, filtarska ploča bit će uronjena pod razina tekućine gnojnice u spremniku, tvoreći sloj akumulacije čvrstih čestica. Kada filtarska ploča napusti razinu tekućine kaše, krute čestice će formirati filtarski kolač i nastaviti dehidrirati pod vakuumom, dodatno sušeći filtarski kolač. Nakon toga, rotor će se okretati do mjesta opremljenog strugačem za uklanjanje filtarskog kolača i transportirati ga pokretnom trakom do željenog mjesta.